Contre Napoléon III, dont le coup d'État en 1851 pousse l'éditeur à l'exil, il publiera notamment Les châtiments de Victor Hugo. Plus tard, il éditera des Communards, à l'image de Paschal Grousset et d'Élisée Reclus.
Enfin, Hetzel : son nom est surtout lié à celui de Jules Verne dont les Voyages extraordinaires seront publiés avec un succès sans cesse renouvelé.
Un aperçu des publications :
- Émile Erckmann (1822-1899) et Alexandre Chatrian (1826-1890) : Waterloo (1865) ; Le blocus : épisode de la fin de l'Empire (1867) ; Contes populaires (7e éd., 1884).
- Victor Hugo (1802-1885) : Les châtiments ("seule édition complète, revue par l'auteur", 1870) ; Napoléon le petit (1870).
- Élisée Reclus (1830-1905) : Histoire d'un ruisseau (1882) ; Histoire d'une montagne (1882).
- George Sand (1804-1876) : Romans champêtres, tome 1 : La mare au diable. François le champi. Promenades autour d'un village. Précédés d'une étude sur les romans champêtres ; Romans champêtres, tome 2 : La petite fadette. La fauvette du docteur. André (1860).
- D'après L. M. Acott, par P.-J. Stahl, Les quatre filles du docteur Marsch (1860).
- Jules Verne (1828-1905) : Le tour du monde en 80 jours (dossiers d'auteurs) ; Cinq semaines en ballon, voyage de découvertes en Afrique par trois Anglais (1865) ; Voyage au centre de la Terre (1867) ; Voyages et aventures du Capitaine Hatteras : les anglais au Pôle Nord, le désert de glace (1867) ; Vingt mille lieues sous les mers (1871) ; Michel Strogoff (1879) ; Le chemin de France ; suivi de Gil Braltar (6 éd., 1888).